مرکز جراحی دارای 4 اتاق عمل فعال با 30 تخت در بخش بستری می باشد. کلیه بیمارانی که نیازمند عمل جراحی می باشند در این بخش بستری و تحت مراقبت قرار می گیرند.
کاتاراکت (آب مروارید)، گلوکوم (آب سیاه)، DCR(عفونت مجرای اشکی)، استرابیسم(انحراف چشم)، شالازیون(گل مژه)، ناخنک چشم، پروبینگ (بازکردن مجرای اشکی)، تزریق آواستین (تزریق داخل چشمی)